為進一步研究多房棘球絳蟲的致病性、藥物靶點以及疫苗診斷試劑的開發提供理論依據,應用生物信息學方法預測分析多房棘球絳蟲(Echinococcus multilocularis,Em)鈣網蛋白(Calreticulin,CRT)的結構和功能。通過基因組數據庫收集數據確定Em-CRT基因和氨基酸序列;利用生物信息學軟件分別對Em-CRT進行蛋白質基本性質、翻譯后修飾位點、功能域、亞細胞定位、二/三級結構、親/疏水性、抗原表位以及進化關系等進行預測和分析。結果表明:Em-CRT基因轉錄本長度為1 188 bp,蛋白全長為395個氨基酸殘基,分子量大小約為45.44 kDa,等電點(pI)為4.47,為穩定蛋白,親水性較高,可溶于水;具有信號肽和信號肽酶剪切位點,為膜外蛋白;Em-CRT具有N端糖基化位點,酪氨酸激酶(TK)Ⅱ磷酸化位點,cAMP和cGMP依賴蛋白激酶磷酸化位點,N端肉豆蔻酰化位點,蛋白激酶C磷酸化位點,酪氨酸激酶磷酸化位點;二級結構以無規則卷曲和α螺旋為主;Em-CRT具有良好的T,B細胞抗原表位。所以,Em-CRT對多房棘球絳蟲個體發育具有重要的作用,且與多房棘球蚴感染免疫密...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 數據準備
    1.2 蛋白質特性預測分析
    1.3 蛋白抗原表位分析
    1.4 分子進化分析
2 結果與分析
    2.1 Em-CRT蛋白基本性質
    2.2 CD4+T 細胞抗原表位結果
    2.3 CD8+T 細胞抗原表位結果
    2.4 B細胞抗原表位綜合分析
    2.5 分子進化分析
3 討論與結論



本文編號：3995704