教育研究可以根據不同的維度加以分類。對一門學科來說，除了具有獨特的研究對象和確定的研究理論以外，還應該有有效的研究方法。研究對象、研究理論和研究方法的科學性和獨特性，是一門學科獨立存在的標志和迅速發展的條件。建國多年來，我國教育研究工作者在研究方法上曾進行了一些探索并取得了一定的成果。十一屆三中全會以來我國教育學研究方法沖破了教條主義的束縛，擺脫了單純依靠思辯進行研究的傳統，在研究當中大量采用實證的方法。特別是近年來，研究方法有了較大發展呈現出多元化的趨勢，統計、測驗、實驗等方法都被廣泛地采用，這對教育學的發展及其科學化起一定的作用。但還必須看到，長期以來由于對教育研究方法的忽視和研究人員自身素質的限制，當前我國教育學研究方法還嚴重落后于一些相鄰學科，落后于國外的發展。教育研究方法尚存在著種種問題和局限。這些問題和局限不僅表現在研究過程中使用的方法單一、落后也表現在思維方法的教條化和片面化。我國教育學研究方法中的局限性，已嚴重影響了教育研究水平的提高制約了教育學的發展。因此我們必須改進現有的研究方法，在保留和發揚已有的優點的基礎上改造現有的方法，創造新的方法，使教育研究方法向著科學化、現代化的方向邁進。
　　1 堅持和正確運用馬克思主義哲學方法論
　　新中國成立之后，馬克思主義成為教育哲學的指導思想。堅持馬克思主義方法論，運用唯物主義歷史觀來分析和研究教育哲學，成為指導我們進行教育研究的理論基石，并取得了一系列可喜的成果。但是隨著時代發展，新問題不斷出現，需要我們用發展的眼光看待問題，而目前國內教育理論界對馬克思主義的教條化理解，限制了研究者獨立思維的視野，影響了教育科學研究的進一步發展。馬克思在《關于費爾巴哈德提綱》中指出：“哲學家們只是用不同的方式去解釋世界，而問題在于改變世界。”我們以馬克思主義指導教育哲學研究，并不是為了理論的探討與發掘，而是要對教育中的一些根本問題，從哲學的高度進行研究和探討，從中找出一般的規律，作為教育理論和實際的指導。如果僅僅憑對馬克思主義的熱情來研究實際問題，到處簡單的套用公式，教條化理解，將無助于人們對馬克思主義采取嚴肅認真的態度。在教育學研究領域，我們必須強調堅持對待馬克思主義應有的科學態度，反對借助馬克思主義的“學術時髦”。這也是我們對于一切理論應有的態度。在這樣的情況下，堅持馬克思主義的指導，倡導多元思想，將更加有利于我國教育理論的研究與發展。
　　2 橫斷科學方法
　　橫斷科學方法主要包括系統論、信息論、控制論、耗散結構論、協同學和突變論，也可以叫做系統科學。之所以叫它橫斷科學，因為它的六個學科都具有橫跨性。系統科學是當代科學綜合發展所提出的新的科學方法論，它為現代科學技術的發展乃至整個人類思維科學的發展提供了新概念、新思路、新方法。目前，系統科學已廣泛地滲人自然科學和社會科學的各門學科中，成為各學科研究普遍運用的重要方法。系統科學的總體思想和方法論原則，對于教育學研究適用是有價值的。首先，因為用橫斷科學的術語講，教育學的根本目的就是要通過對教育的整體研究，探索實現教育有序化的優化途徑。其次，對作為教育學研究對象的特點，綜合起來造成了教育學的橫跨性特征，而橫斷科學的基本思想和方法的通用性，正好適用教育學橫跨研究的需要。
　　長期以來，教育領域的研究存在如下問題：一是，研究方法比較單調，導致一些應用研究適用范圍有限，筆耕文化傳播，缺乏普遍性；二是，理論研究容易出現老生常談或信口開河等現象，定量研究和實證研究不夠，使研究結果缺乏說服力；三是，很多研究僅局限于實際問題和停留在經驗層次上，沒有上升到理論或學術層面，導致研究的學術性不強。教育研究引入橫斷科學思想，使上述情況得到了明顯改善。
　　首先，橫斷科學促使教育研究在某種程度上向定量化方向發展。系統科學認為，只有進行精確的定量的研究，才能更深人地認識事物和系統的本質，要求在處理問題時應盡量采取各種數學語言和數學工具，使問題得到定量的精確的表述。運用系統科學開展高等教育研究，可以借助于電子技術、系統工程、圖論、集合論等現代化技術和數學手段，對教育系統之間的復雜聯系進行定量描述，建立數學模型，從而使關于高等教育系統中各種要素之間普遍聯系的表述更加定量化和精確化。

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