本文選題：肝癌高發家系　切入點：一級親屬　出處：《福建醫科大學》2016年碩士論文　論文類型：學位論文

【摘要】：目的:篩查福建肝癌高發家系肝癌患者、患者一級親屬與正常對照組的亞畸變染色體及差異基因,并通過聚類分析定位基因產物功能。方法:采血抽提肝癌高發家系肝癌組、患者一級親屬組、健康對照組基因組,采用高分辨率微陣列比較基因雜交技術(array-CGH)進行全基因組掃描,篩查出亞畸變染色體及差異基因,應用GORILLA在線分析軟件對差異基因進行聚類分析。結果:染色體亞畸變及基因差異:肝癌組、親屬組、對照組均有不同程度的DNA拷貝數差異(擴增和缺失),共檢查出亞畸變染色體區段86處,涉及206個差異基因。各組間染色體平均擴增數及缺失數差異無統計學意義(P=0.945)。染色體擴增和缺失頻率在三組間的差異均無統計學意義(P0.05)。差異基因頻率在三組間的差異均無統計學意義(P0.05)。聚類分析結果:206個差異基因進行聚類分析后,其中31個基因存在顯著富集,分別為APOBEC3A、APOBEC3B、DEFB103A、DEFB103B、DEFB104A、DEFB104B、DEFB105A、DEFB105B、DEFB106A、DEFB106B、DEFB107A、DEFB107B、NPY4R、OR11H12、OR11H2、OR2T10、OR2T11、OR2T34、OR2T35、OR4C6、OR4K1、OR4K2、OR4K5、OR4M1、OR4M2、OR4N2、OR4N4、OR4P4、OR4Q3、OR4S2、ZDHHC11。上述差異基因主要存在于細胞膜部分;分子功能上表現為G蛋白偶聯受體活性、跨膜受體活性、信號轉導、嗅覺受體活性、分子轉導活性;在生物學過程中與G蛋白偶聯受體信號通路、對化學刺激的感知、對刺激的感知、信號轉導、嗅覺感知、調控細胞過程、調節生物進程等相關。其中GO:0004930(P=1.43E-10)和GO:0007186(P=3.95E-10)富集最為顯著。結論:(1)肝癌患者存在明顯的染色體擴增和缺失,且部分染色體亞畸變是非隨機的(頻率超過10%被認為是非隨機位點);(2)本研究中染色體亞畸變及差異基因與福建肝癌高發家系肝癌的發生無顯著相關性;(3)G蛋白偶聯受體及其介導的信號通路可能與福建原發性肝癌的發生、發展有關。
[Abstract]:Objective: to screen subaberrant chromosomes and differentially expressed genes between first-degree relatives and normal controls in a family with high incidence of liver cancer in Fujian Province, and to locate the function of gene products by cluster analysis. The first degree relatives of the patients and the healthy control group were scanned by high-resolution microarray comparative gene hybridization technique to screen subaberrant chromosomes and differential genes. GORILLA online analysis software was used to cluster analysis of differential genes. Results: chromosome subaberration and gene difference: liver cancer group, relatives group, In the control group, there were different DNA copy numbers to varying degrees (amplification and deletion), and 86 subaberration chromosomal regions were detected. There was no significant difference in the average number of chromosomes and the number of deletions among the three groups. There was no significant difference in the frequency of chromosome amplification and deletion among the three groups, and there was no significant difference in the frequency of chromosome amplification and deletion among the three groups. The difference in the frequency of the differentially expressed genes among the three groups was not significant. The results of cluster analysis showed that 206 differentially expressed genes were analyzed by cluster analysis. Among them, 31 genes were significantly enriched, namely APOBEC3B3DEFB103AB103A, DEFB104ADEFB104ADEFB105ADEFB105ADEFB105ADEFB105ADEFB105ADEFB106ADEFB106ADEFB107BNPY107BNPY4ROR11H12H2OR2T10OR2T10OR2T32OR2T3OR2T3OR4C6OR4K4K2OR4K1OR4M1O4N4N4N4OR4OR4OR4OR4OR4OR4Q4S2H2H2OR2OR2OR2T2T3OR2OR2OB104OR4K2OR4M4N4N4N4N4OR4OR4OR4OR4Q4S2OB107BB107BNPY4ROR11H12H2OR2T102OR2T2OR2T3OR2T3OR2OR4C6O4K4K2OR4M4M2N4N4N4OR4OR4OR4OR4OR4OR4OQ4OQ4OQ4OQ2OQ2H2OR2OR2T2OB102OR2T2OR2T3OR2T3OR2OR2T102T3OR2OR2T3OR2OR2@@. Molecular transduction activity; receptor signaling pathway coupled with G protein in biological processes, perception of chemical stimuli, perception of stimuli, signal transduction, olfactory perception, regulation of cellular processes, Regulation of biological processes, among them, the enrichment of GO0004930 (1.43E-10) and GO00071866 (Pn3.95E-10) is the most significant. Conclusion there is significant chromosome amplification and deletion in patients with liver cancer. And some chromosomal subaberrations are non-random (frequency over 10% is considered as non-random locus) in this study, there is no significant correlation between chromosomal subaberration and differential genes and the occurrence of HCC in Fujian high incidence families. Receptor and its mediated signaling pathway may be associated with the occurrence of primary liver cancer in Fujian. Development is relevant.
【學位授予單位】：福建醫科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R735.7

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本文編號：1559536