【摘要】：Polycomb group(PcG)蛋白是多細胞有機體中的一類表觀遺傳抑制因子,Ring是Pc G蛋白家族的主要成員,在Pc G蛋白的轉錄抑制調控中行使重要功能,對昆蟲和哺乳動物的發育至關重要。利用同源檢索方法獲得家蠶Ring基因(BmRing)的核苷酸序列,該基因位于家蠶第17號染色體的nscaf2865位點。BmRing的核苷酸序列由4個外顯子和3個內含子構成,基因的c DNA3'端有2個多聚腺苷酸化信號(aataaa)和典型的poly(A)結構;BmRing編碼由377個氨基酸組成的蛋白質,分子質量為41.8 k D,等電點為6.72,氨基酸序列具有3個同源異型結構域(homeobox domain,HD),46~85 aa為高度保守的典型的環指結構域(Ring finger),331~347 aa為跨膜區,N端位于膜外。通過STRING在線預測分析得到10個與BmRing有相互作用關系的蛋白質。系統進化分析顯示BmRing與果蠅的Dm SCE、意大利蜜蜂的AmRing等的親緣關系較近。以家蠶5齡第3天幼蟲的卵巢c DNA為模板,克隆了BmRing基因,并利用半定量RT-PCR檢測BmRing基因在5齡第3天幼蟲的精巢、卵巢、頭部和血細胞中有明顯表達,而在其他組織中幾乎不表達。獲得的上述基礎信息,有益于進一步研究BmRing的生物學功能。
[Abstract]:Polycomb group (PcG) protein is an epigenetic inhibitor in multicellular organisms. Ring is a major member of Pc G protein family. It plays an important role in the regulation of transcription inhibition of Pc G protein and plays an important role in the development of insects and mammals. The nucleotide sequence of Ring gene (BmRing) of Bombyx mori was obtained by homology search method. The nucleotide sequence of BmRing gene was composed of 4 exons and 3 introns, which was located at the nscaf2865 site of chromosome 17 of Bombyx mori. There are two polyadenylate signal (aataaa) and typical poly (A) structure at the c DNA3' end of the gene. BmRing encodes a 377 amino acid protein with a molecular weight of 41.8 KD and a isoelectric point of 6.72. The amino acid sequence has three homologous domains (homeobox domain,HD). 46 ~ 85 aa is a typical conserved ring finger domain, (Ring finger), 331n 347 aa is a transmembrane region, and the N terminal is located outside the membrane. Ten proteins with interaction with BmRing were obtained by STRING online prediction analysis. Phylogenetic analysis showed that BmRing was closely related to Dm SCE, of Drosophila melanogaster Dm SCE, AmRing et al. The BmRing gene was cloned from the ovary c DNA of the 3rd day larva of the 5th instar of Bombyx mori. The expression of BmRing gene was detected by semi-quantitative RT-PCR in the spermary, ovary, head and blood cells of the 3rd day larva of the 5th instar. In other tissues there is little expression. The above basic information is helpful to further study the biological function of BmRing.
【作者單位】： 江蘇科技大學生物技術學院;家蠶基因組生物學國家重點實驗室西南大學;
【基金】：國家自然科學基金項目(No.31302035) 江蘇省高校自然科學基金項目(No.13KJD230001) 江蘇省自然科學基金項目(No.BK2012273) 江蘇科技大學引進人才科研啟動基金項目(No.35181005,35181003)
【分類號】：S881.2;Q78

【相似文獻】

相關期刊論文 前10條

1 王洪波;郭珍珍;于家峰;王吉華;;基于序列及結構特征的固有無序蛋白—核酸相互作用位點預測分析[J];德州學院學報;2014年02期

2 焦典;顧珉;傅靜;李石法;謝建明;孫嘯;;基于特征的核酸序列數據庫搜索系統[J];中國生物醫學工程學報;2006年06期

3 張光亞;葛慧華;方柏山;;基于不同序列特征值預測氧化還原酶輔酶類型的研究[J];計算機與應用化學;2008年05期

4 喻達輝,李有寧,吳開暢;中國、日本和澳大利亞珍珠貝的ITS2序列特征分析[J];南方水產;2005年02期

5 張強;李宏;趙小慶;許士華;;基因外顯子連接序列與相應內含子序列的相互作用[J];生物信息學;2013年03期

6 陳翠霞,李前忠;模式生物基因序列的識別[J];內蒙古大學學報(自然科學版);2005年04期

7 韓忠敏;昝玉璽;王天云;;人β-干擾素核基質結合區序列的克隆與分析[J];鄭州鐵路職業技術學院學報;2007年02期

8 吳敏;王星果;張營;徐建榮;顧志良;;溼線粒體ND5基因測序與序列特征分析[J];常熟理工學院學報;2011年02期

9 曹贊霞;張紅梅;趙巖;王吉華;;固有無序蛋白質無序與有序接點處的氨基酸序列分析[J];生物物理學報;2011年09期

10 安華明;黃偉;樊衛國;劉慶林;陳力耕;;刺梨半乳糖內酯脫氫酶的序列特征和部分反應特性[J];西南大學學報(自然科學版);2008年12期

相關會議論文 前2條

1 郭潤芳;李多川;;疏綿狀嗜熱絲孢菌耐熱幾丁質酶基因的cDNA克隆及序列特征[A];2005熱帶亞熱帶微生物資源的遺傳多樣性與基因發掘利用研討會論文集[C];2005年

2 謝勇;李東宏;張建中;周南進;薛國輝;劉東升;呂農華;;我國幽門螺桿菌外膜蛋白OipA、BabA和SabA的序列特征[A];2012中國消化系疾病學術大會論文匯編[C];2012年

相關博士學位論文 前1條

1 徐東;轉錄因子結合位點預測算法的研究與應用[D];上海大學;2005年

相關碩士學位論文 前8條

1 焦典;基因組序列特征分析[D];東南大學;2005年

2 顧珉;基于序列統計特征的水平轉移基因搜索[D];東南大學;2006年

3 胡奇光;基于統計特征的DNA序列特征提取方法研究[D];湖南大學;2011年

4 徐s，

本文編號：2303488