線粒體是真核生物所不可或缺的雙層膜結構的細胞器,動物線粒體DNA (mitochondrial DNA)具有進化速度快,嚴格母系遺傳,不存在基因重組等特征,因此是基因功能研究和物種遺傳進化研究的好材料。 北方須鰍(Barbatula toni)隸屬于鯉形目、鰍科、條鰍亞科、須鰍屬,本研究通過參考北方須鰍的近緣物種須鰍的線粒體基因組全序列,共計設計了26對引物,采用溫度梯度PCR技術擴增出了北方須鰍線粒體基因組的全序列,然后運用相關軟件對其進行分析研究,結合NCBI中已公布的鰍科魚類的線粒體基因組信息,構建鰍科魚類系統發育樹,研究結論如下： 1.北方須鰍線粒體基因組全長16619bp,其中4721個堿基A,占28.4%,2978個堿基G,占17.9%,4399個堿基T,占26.5%,4521個堿基C,占27.2%,A+T含量為54.9%,明顯大于G+C含量,其中D-loop區A+T的含量最高,達到67.3%。 2.北方須鰍線粒體基因組總共編碼37個基因,即13個蛋白質編碼基因(PCGs),2個rRNA基因,22個tRNA基因與1個控制區序列。其中Gln、 Pro、 Ala、 Cys、 A...

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【學位級別】：碩士

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摘要
Abstract
縮略語表
第一章 前言
    1.1 線粒體概述
        1.1.1 線粒體簡介
        1.1.2 線粒體基因組的大小和組成
    1.2 線粒體基因組的特征
        1.2.1 線粒體基因組的結構特征
        1.2.2 線粒體基因組的遺傳特征
        1.2.3 線粒體基因組的進化特征
    1.3 線粒體基因組的研究方法
        1.3.1 線粒體DNA的提取和擴增
        1.3.2 線粒體DNA的序列測定
        1.3.3 線粒體DNA的拼接和注釋
    1.4 魚類線粒體基因組研究進展
        1.4.1 線粒體DNA多態性在魚類分子遺傳學中的研究進展
        1.4.2 線粒體DNA在魚類分子系統學上的研究進展
    1.5 研究的目的與意義
        1.5.1 鰍科簡介及分類概況
        1.5.2 研究物種介紹
        1.5.3 本研究的目的與意義
第二章 材料和方法
    2.1 實驗材料及用具
        2.1.1 生物樣品的采集與鑒定
        2.1.2 實驗儀器
        2.1.3 實驗試劑
        2.1.4 生物信息學分析軟件
    2.2 實驗方法
        2.2.1 總DNA的提取
        2.2.2 總DNA的檢測
        2.2.3 PCR的引物設計
        2.2.4 PCR的擴增和檢測
        2.2.5 PCR產物測序
    2.3 數據處理和分析
        2.3.1 線粒體基因組序列的拼接和注釋
        2.3.2 線粒體基因組分析
    2.4 鰍科魚類的系統發育分析
        2.4.1 數據的收集
        2.4.2 系統進化樹的建立
第三章 實驗結果與討論
    3.1 總DNA提取結果
    3.2 PCR擴增結果
    3.3 北方須鰍線粒體基因組全序列結果分析
        3.3.1 北方須鰍線粒體基因組結構
        3.3.2 北方須鰍核苷酸組成
        3.3.3 北方須鰍線粒體基因組蛋白質編碼基因分析
        3.3.4 北方須鰍線粒體基因組tRNA基因和rRNA基因的結構分析
        3.3.5 北方須鰍線粒體基因組控制區(D-loop區)
    3.4 鰍科魚類系統發育分析
        3.4.1 根據12SrRNA和16SrRNA基因的鰍科魚類系統發育分析
第四章 討論
    4.1 PCR實驗條件優化
    4.2 北方須鰍線粒體基因組和其他魚類線粒體基因組比較
    4.3 鰍科魚類的系統發育
參考文獻
附錄
致謝



本文編號：3994421