MEK1/2全長結構及磷酸化激活的分子機理的計算結構生物學研究
發布時間:2024-06-11 22:16
多種信號經由相同或類似信號分子傳遞,導致不同生物學效應,是一種廣泛存在的細胞信號轉導現象,有關其中共同通路部分如何對不同信號進行分揀和傳遞,其詳細的分子構象過程和機理目前并不完全清楚。 ERK/MAPK信號通路就是這樣一條重要的細胞內共同通路。與胞外信號分子結合后,多種細胞表面受體都可引發MEK和ERK的依次磷酸化激活,磷酸化激活的ERK可再與上百種下游蛋白底物(如轉錄調控因子)相互作用,從而調節多種基因的表達并引起相應的細胞變化。研究表明,不同信號經ERK/MAPK信號通路傳遞后可產生不同甚至相反的細胞生物學效應。值得注意的是,MEK作為該通路中的一個關鍵節點分子,只包括兩個蛋白分子(MEK1和MEK2),而且其蛋白序列具有很高的相似性,卻可以分別傳遞如此眾多的不同信號,勢必與其細微的構象變化密切相關,但具體機理目前并不清楚。因此,研究MEK蛋白分子在各種功能狀態下的三維結構動態性,將為解釋此類共同通路的信號分揀傳遞原理提供非常好的范例。 經過多年努力,目前已獲得MEK分子的多個三維結構,但無一例外,它們都缺失三部分的構象信息,即N端區、PR區和C端區;分析認為這三個部分都具有相當的...
【文章頁數】:113 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
本文編號:3992797
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【部分圖文】:
圖1.MAPK信號通路示意圖
軍事醫學科學院碩士學位論文前言receptor)、PDGFR(platelet-derivedgrowthfactorreceptor)和TRK(tyrosinekinasereceptor)A,B等。活化的RAF可將MEK的兩個特定絲氨酸磷酸化,使MEK....
圖31S9件為
軍事圖2*號插入有明序列這種ERK事醫學科學院碩2.MEK1和表示相同氨入的空格。MEK1和明顯構象差列比對顯示種序列差異K/MAPK通碩士學位論文MEK2的序氨基酸,:表序列比對軟MEK2具有差異(圖3)。示,MEK1和異與其功能通路在MEK序列比對圖表示保....
圖1.1,利用SOPMA服務器[35]對MEK1和MEK2進行二級結構預測的結果
軍事醫學科學院碩士學位論文第一部分MEK分子完整三維結構的構建致,因此在該區域很可能會形成一個長螺旋。因此我們選擇對MEKN端缺失部分進行單獨手動構建多肽并進行分子動力學模擬,通過對其模擬軌跡的分析研究它的從頭折疊過程,從而獲得合適的構象后進行MEK完整三維結構的....
圖1.2,M64和M68初始結構圖
覆蓋二級結構預測顯示的螺旋區域(MEK1中的Ala26-Glu62,MEK2中的Ser30-Glu66),這樣選擇的好處是可以獲得一個完整的螺旋,有下一步進行結構構建;四,MEK1和MEK2選擇的序列必須要符合比對的結果,便于進一步MEK1和MEK2的N端....
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