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IKCa1相關的miRNA對HeLa細胞增殖、遷移及侵襲作用機制初探

發布時間:2020-11-16 17:59
   目的:1.探討中電導鈣激活鉀離子通道(IKCa1)對HeLa細胞增殖、遷移及侵襲特性的影響;2.探究IKCa1對miRNA表達譜的影響,篩選出與IKCa1相關的miRNA,并通過生物信息學預測其靶基因,對其靶基因進行功能分析(GO分析),篩選出差異顯著的mi RNA,,對其靶基因進行信號通路富集分析,初步探索IKCa1相關miRNA與HeLa細胞增殖、侵襲及轉移的相關關系,為進一步探究mi RNA在預防和治療宮頸癌的靶標分子中提供了線索。方法:1.分別設置濃度為0、10.0、20.0、30.0、40.0μmol/L TRAM-34(IKCa1特異性阻斷劑)為觀察1-5組及等體積的DMSO組(TRAM-34溶劑)處理HeLa細胞24h、48h和72h,采用CCK8實驗檢測HeLa細胞增殖特性;采用劃痕實驗測量HeLa細胞實際遷移距離從而檢測HeLa細胞遷移特性;2.按上述6組分組處理HeLa細胞48小時后用Transwell實驗檢測其侵襲特性;3.通過本研究前期預實驗、查閱相關文獻、結合CCK8實驗及劃痕實驗結果篩選0.0、30.0μmol/L TRAM-34分別處理HeLa細胞48小時作為對照組和實驗組,采用高通量測序方法檢測IKCa1阻斷前、后miRNA表達譜的變化;4.采用q RT-PCR法對部分差異顯著表達miRNAs進行驗證,從而驗證高通量測序結果的準確性;5.運用mi Randa、miRWalK、Targetscan、DIANAmT、miRDB等軟件預測篩選的差異顯著表達miRNA可能調控的靶基因以及GO功能分析;再從表達譜中上調和下調的miRNA中各選一個與宮頸癌密切相關的mi RNA作為研究對象即為靶miRNA,對其靶基因進行信號通路富集分析。結果:1.CCK8實驗提示TRAM-34抑制HeLa細胞的增殖,在一定范圍內,具有劑量依賴性,在培養細胞24h時DMSO組、觀察1組和觀察2組三組間差異均不具有統計學意義(p0.05),其余各組與DMSO組及與觀察1組之間具有顯著性差異(p0.001);而培養HeLa細胞48、72h后,DMSO與觀察1組間差異不具有統計學意義(p0.05),而其余各觀察組與觀察1組、DMSO組之間差異均具有統計學意義(p0.001),提示本實驗中MDSO濃度對HeLa細胞無影響;劃痕實驗提示TRAM-34能抑制HeLa細胞遷移,在一定范圍內,具有時間及劑量依賴性,隨著濃度增加及作用時間延長,抑制遷移作用越明顯(p0.001))。2.Transwell侵襲實驗證明,在一定濃度范圍內,HeLa細胞的侵襲率隨TRAM-34濃度增加呈遞減趨勢(F=384.050,p0.001)。3.分析對照組與實驗組的mi RNA高通量測序結果,通過對不同樣本的Clear data的比較,分析其共有序列及特有的序列,以Fold Change≧1.5,qvalue0.01為差異顯著表達的篩選標準,在871條差異表達中篩選出20個差異顯著表達的mi RNAs,其中15個差異miRNA表達上調,5個差異miRNA表達下調。4.結合高通量測序結果及查閱相關文獻,在15個表達上調的mi RNA中挑選4個(hsa-miR-451a、hsa-miR-122-5P、hsa-miR-143-3P、hsa-miR-223-3P)和5個表達下調的miRNA中挑選1個(hsa-mi R-421)進行qRT-PCR驗證,結果顯示hsa-miR-451a、hsa-miR-122-5P、hsa-miR-143-3、hsa-miR-421表達量的變化趨勢與高通量測序的結果一致,在實驗組與對照組中差異均具有統計學意義(P0.05),從而檢測高通量測序結果的準確性;5.通過生物信息學分析發現,差異顯著的miRNA的靶基因主要富集蛋白結合,細胞代謝過程、運輸過程等條目;其中hsa-miR-143-5P、hsa-mi R-421與多種腫瘤的發生、發展密切相關。通過對hsa-miR-143-5P、hsa-miR-421進一步行信號通路分析發現,hsa-miR-143--5P靶基因主要涉及到腫瘤蛋白多糖、p53信號通路、癌癥相關通路及MAPK信號通路等過程,其中在p53信號通路、MAPK信號通路達到顯著性富集水平(p0.01);而hsa-mi R-421靶基因主要涉及到腫瘤蛋白多糖、Rap1信號通路和Wnt信號通路等過程,其中在Wnt信號通路達到顯著性富集(p0.01)。結論:推測IKCa1可通過影響相關mi RNAs表達,進一步影響其靶基因在p53/MAPK/Wnt信號通路上的調控,從而對HeLa細胞增值、遷移及侵襲產生影響。抑制IKCa1可抑制HeLa細胞增值、遷移和侵襲。
【學位單位】:西南醫科大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2018
【中圖分類】:R737.33
【部分圖文】:

細胞遷移,實際距離


of HeLa cells( x s)組別Hela 細胞遷移實際距離(μm)24h 48h 72hDMSO 組 170.05±0.74 227.78±5.37 290.80±0.78觀察 1 組 173.01±4.04 234.34±4.66 297.15±4.43觀察 2 組 128.09± 4.73* 187.16±4.96* 240.34±3.34*觀察 3 組 109.95±4.79* 165.90±11.37* 190.95±10.60*觀察 4 組 64.60±4.84* 105.48±4.53* 137.01±5.96*觀察 5 組 45.66±4.60* 64.10±5.73* 81.93±12.48*注:與 DMSO 組相比,*P<0.001。Note:compared with group DMSO,*P<0.001

小RNA,大小分布,細胞,濃度


表 6 各組 HeLa 細胞總 RNA OD260/280 及 6 Total RNAOD260/280 and concentrationOD260/280 濃度(ng/ul) 1 1.96 187.9 2 1.83 201.7 3 1.87 190.3 1 1.83 303.6 2 1.92 329.3 3 2.01 327.7

擴增曲線,實驗組,高通量,測序


西 南 醫 科 大 學 碩 士 學 位 論 文法從上調差異顯著表達的 miRNAs 中選擇 4 個 miRNAs(hsa-miR-451a、sa-miR-122-5P、hsa-miR-143-3P、hsa-miR-223-3P)和下調差異顯著表達 miRNAs 中挑選一個(hsa-miR-421)進行驗證。實驗組與對照組中各測 miRNA 和內參 U6 的溶解曲線及擴增曲線如圖 5A、5B 所示;溶解線僅出現一個單一峰,提示引物特異性好;說明所測的 Ct 值可應用后檢測。而通過 RT-PCR 結果發現 hsa-miR-451a、hsa-miR-122-5P、sa-miR-143-3、hsa-miR-421 表達量的變化趨勢與高通量測序的結果基本致(P<0.05),進一步證實了高通量測序結果的準確性,見圖 6。
【相似文獻】

相關期刊論文 前4條

1 吳周環;顏瑞巧;劉建云;車向新;熊建軍;;核轉運抑制肽表達載體的構建及對HeLa細胞增殖、遷移的影響[J];四川大學學報(醫學版);2017年06期

2 王曉慧;阮杰;羅蘇亞;;高表達p27基因對子宮頸癌HeLa細胞增殖的影響研究[J];安徽衛生職業技術學院學報;2018年05期

3 徐雅杰;張志強;于鶴;;和厚樸酚通過上調miR-99a/b抑制HeLa細胞增殖和侵襲[J];醫學研究雜志;2018年11期

4 董紅玲;;鋅指蛋白267在宮頸癌中的表達水平及其對HeLa細胞增殖、凋亡、周期的影響[J];中國婦幼保健;2019年06期


相關碩士學位論文 前2條

1 韓軍軍;白藜蘆醇抑制HeLa細胞增殖及誘導自噬的線粒體機制初探[D];河北大學;2018年

2 程慧;IKCa1相關的miRNA對HeLa細胞增殖、遷移及侵襲作用機制初探[D];西南醫科大學;2018年



本文編號:2886500

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