蠟梅作為常用的園林植物和木本切花,由于其獨特的開花時間和濃郁的花香,具有較高的觀賞價值和經濟價值,其觀賞價值主要取決于花朵的開放情況,為了探索乙烯是否影響蠟梅的花朵開放,本文使用乙烯和1-MCP處理蠟梅花朵,利用RNA-seq技術,探索乙烯對蠟梅花朵的影響及克隆乙烯響應因子基因,為調控蠟梅花朵開放,改善切花品質提供幫助。本研究的主要結果如下:1.在本研究中,提取蠟梅蕾期花朵總RNA,利用高通量Illumina HiSeq4000平臺測序,共得到0h樣本40264927條clean data、4h樣本41064633條clean reads、4hEth樣本39230880條clean reads、24h樣本41158515條clean reads和24h1-mcp樣本40851828條clean reads。用Trinity軟件對所有的clean reads進行拼接,共得到了195349個轉錄本序列,平均長度為919bp。2.將拼接得到的Unigene序列與NR、SwissProt、COG、GO和KEGG等數據庫進行比對,其中,共有52352（26.8%）條轉錄本序列在NCBI非冗余獲得了...

【文章頁數】：86 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1-1乙烯的生物合成途徑[35]

西南大學碩士學位論文及葉片脫落、衰老等很多階段都起著極其重要的調控作用[33-34]前體是蛋氨酸（Methionine），直接前體是1-氨基環丙烷-1-羧酸（公認的乙烯合成過程是通過YangCycle，蛋氨酸在蛋氨酸腺腺S-腺苷蛋氨酸，它是許多細胞的甲基供體，并在1-氨....

圖1-2RNA-Seq的典型流程

西南大學碩士學位論文于傳統的Sanger測序而言，基于高通量的RNA測序技術（RNA-Seq）經濟且通量高，而且不需依附基因組信息即可進行轉錄組研究，大大加快了非模物的研究。RNA-Seq己經成為應用最為廣泛的轉錄組研究方法。RNA-Se下諸多優勢：（1）通量高；（2）....

圖3-1真核轉錄組實驗流程

圖3-1真核轉錄組實驗流程切及統計的原始圖像數據經過BaseCalling轉原始測序數據（RawData）文件。FQ堿基序列以及測序質量等基本信息。堿基質量字符，每個堿基質量字符對應系），即為該堿基的測序質量得分(Ph代表不同的堿基測序錯誤率，如當Q為1%和....

圖3-2Trinity算法原理示意圖

步Inchworm將原始序列建立起一個k-mergraph（K=25），通法尋找graph中的所有路徑，inchworm每搜索到一條路徑就“contig”，最后得到了一組“contig”；步Chrysalis，將第一步得到的“contig”進行分組，這時如果所得中....

本文編號：4054182