龍頭魚(yú)ISSR-PCR多態(tài)性引物最佳退火溫度的篩選
發(fā)布時(shí)間:2025-07-19 00:55
為了開(kāi)展龍頭魚(yú)遺傳多樣性和近緣物種間的遺傳變異分析,建立龍頭魚(yú)的簡(jiǎn)單序列重復(fù)區(qū)間標(biāo)記(inter-simple sequence repeat,簡(jiǎn)稱(chēng)ISSR)-PCR反應(yīng)體系,擬篩選龍頭魚(yú)ISSR-PCR多態(tài)性引物的最佳退火溫度。參考加拿大哥倫比亞大學(xué)(UBC)公布的100條ISSR引物,采用溫度梯度PCR的方法,得到適用于龍頭魚(yú)基因組DNA擴(kuò)增的12條ISSR分子標(biāo)記引物,分別為811、834、836、840、841、842、844、853、873、880、881、899。12條引物中,最高退火溫度為58.9℃,最低退火溫度為47℃,兩者間的差異達(dá)到了11.9℃。12條引物的變異系數(shù)為7.71%,相關(guān)系數(shù)為0.23。結(jié)果表明,龍頭魚(yú)ISSR多態(tài)性引物的最佳退火溫度與理論退火溫度間沒(méi)有顯著相關(guān)性,同一種引物的退火溫度在不同物種中也存在一定的差異,需要通過(guò)溫度梯度試驗(yàn)進(jìn)行具體分析。
【文章頁(yè)數(shù)】:4 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 樣本采集和DNA提取
1.2 引物序列和退火溫度的設(shè)定
1.3 ISSR-PCR反應(yīng)體系與反應(yīng)條件
1.4 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
3 討論
4 結(jié)論
本文編號(hào):4057721
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1 材料與方法
1.1 樣本采集和DNA提取
1.2 引物序列和退火溫度的設(shè)定
1.3 ISSR-PCR反應(yīng)體系與反應(yīng)條件
1.4 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
3 討論
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