【摘要】：利用隱馬可鏈夫模型(HMM)對(duì)芝麻全基因組Hsp70基因進(jìn)行了系統(tǒng)分析,共鑒定出21個(gè)Hsp70基因,其中17個(gè)屬于Dnak基因亞家族,4個(gè)屬于Hsp110/SSE基因亞家族。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析和亞細(xì)胞定位結(jié)果,將芝麻21個(gè)Hsp70基因分為6個(gè)亞組,其中I亞組3個(gè),定位于葉綠體;II亞組2個(gè),定位于線粒體;III亞組5個(gè),定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng);IV亞組6個(gè),定位于細(xì)胞質(zhì)基質(zhì);V亞組4個(gè),屬于Hsp110/SSE基因家族;VI亞組1個(gè)。芝麻Hsp70基因啟動(dòng)子區(qū)域順式作用元件功能預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,Hsp70基因參與芝麻的生長(zhǎng)發(fā)育和逆境脅迫響應(yīng)等生理過(guò)程。
[Abstract]:The whole genome Hsp70 gene of sesame seeds was systematically analyzed by using the hidden Ma Ke chaff model (HMM). A total of 21 Hsp70 genes were identified, of which 17 belonged to the Dnak gene subfamily and 4 belonged to the Hsp110/SSE gene subfamily. According to phylogenetic tree analysis and subcellular localization, 21 Hsp70 genes of Sesame were divided into 6 subgroups, of which 3 were subgroups I, 2 were located in mitochondria, 2 were located in mitochondria, 5 were located in endoplasmic reticulum (ER), 2 in II subgroup and 5 in endoplasmic reticulum (ER). Six subgroups of IV were located in the cytoplasmic matrix, four in subgroup V, belonging to the Hsp110/SSE gene family, and one in the VI subgroup. The predicted function of cis-acting elements in the promoter region of sesame Hsp70 gene showed that Hsp70 gene was involved in the physiological processes such as growth and development of sesame seeds and stress response.
【作者單位】： 江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟(jì)作物研究所;
【基金】：江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新基金項(xiàng)目[CX(14)2038]
【分類(lèi)號(hào)】：S565.3

【參考文獻(xiàn)】

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1 李靜婷;劉子記;趙旭耀;朱小葉;;小麥小分子熱激蛋白TasHSP16.9基因在逆境應(yīng)答中的表達(dá)分析[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2016年07期

2 張青;陸明星;祝樹(shù)德;;灰飛虱2種熱激蛋白基因Hsp70的克隆、分析[J];江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2015年06期

3 姜建軍;王鳳英;黃立飛;陳紅松;李磊;楊朗;;瓜實(shí)蠅熱激蛋白基因hsp70的克隆及序列分析[J];南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2015年05期

4 李翠;侯蕾;任麗;張燁;鄭奕雄;王興軍;;花生熱激蛋白AhHSP70與熱激因子AhHSF基因的克隆及表達(dá)分析[J];山東農(nóng)業(yè)科學(xué);2015年04期

5 胡秀麗;李艷輝;楊海榮;劉全軍;李潮海;;HSP70可提高干旱高溫復(fù)合脅迫誘導(dǎo)的玉米葉片抗氧化防護(hù)能力[J];作物學(xué)報(bào);2010年04期

【共引文獻(xiàn)】

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2 張杰;單寶來(lái);田永生;彭日荷;姚泉洪;汪良駒;;葡萄HSP17基因的合成與功能分析[J];江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2017年03期

3 于康珂;孫寧寧;齊紅志;詹靜;顧海靖;劉剛;潘利文;劉天學(xué);;不同成熟度玉米葉片光合生理對(duì)高溫脅迫的響應(yīng)特征及其基因型差異[J];河南農(nóng)業(yè)科學(xué);2017年05期

4 李雅博;李婷;韓瑩琰;范雙喜;;葉用萵苣熱激蛋白基因LsHsp70-2711的克隆及高溫脅迫下的功能分析[J];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué);2017年08期

5 Panxia LIANG;Jiangtao ZHOU;Xing HUANG;Yangrui LI;;Cloning of Small Heat-shock Protein(sHSP)Gene from Sugarcaneand Analysis of Its Expression under Drought Stress[J];Agricultural Biotechnology;2017年02期

6 單長(zhǎng)卷;陳向東;;稀土元素釹對(duì)玉米幼苗根系抗旱性的影響[J];玉米科學(xué);2017年03期

7 單長(zhǎng)卷;楊天佑;;谷胱甘肽對(duì)鹽脅迫下玉米幼苗抗氧化特性和光合性能的影響[J];西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2017年02期

8 TAO Zhi-qiang;CHEN Yuan-quan;LI Chao;ZOU Juan-xiu;YAN Peng;YUAN Shu-fen;WU Xia;SUI Peng;;The causes and impacts for heat stress in spring maize during grain filling in the North China Plain——A review[J];Journal of Integrative Agriculture;2016年12期

9 胡樹(shù)平;蘇治軍;于曉芳;陳春梅;高聚林;呂佳雯;王鵬飛;許子清;;玉米自交系抗旱相關(guān)性狀的主成分分析與模糊聚類(lèi)[J];干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究;2016年06期

10 陳湘瑜;徐日榮;熊發(fā)前;唐兆秀;;野生花生Hsp70基因家族的全基因組鑒定及生物信息學(xué)分析[J];中國(guó)油料作物學(xué)報(bào);2016年05期

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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1 孫愛(ài)清;葛淑娟;董偉;單曉笛;董樹(shù)亭;張杰道;;玉米小分子熱激蛋白ZmHSP17.7基因的克隆與功能分析[J];作物學(xué)報(bào);2015年03期

2 Jingting Li;Zhenzhong Wang;Huiru Peng;Zhiyong Liu;;A MITE insertion into the 3′-UTR regulates the transcription of TaHSP16.9 in common wheat[J];The Crop Journal;2014年06期

3 宮本賀;易瑾;隋娟娟;吳健;吳澤;程運(yùn)河;吳晨雨;劉晨;義鳴放;;麝香百合熱激轉(zhuǎn)錄因子基因LlHsfA1的克隆與表達(dá)分析[J];園藝學(xué)報(bào);2014年07期

4 張青;陸明星;祝樹(shù)德;;灰飛虱熱激蛋白Hsp90基因的克隆、序列分析與表達(dá)模式[J];昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);2014年07期

5 孫猛;陸明星;湯小天;杜予州;;大螟HSC70基因克隆及表達(dá)模式分析[J];昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);2014年07期

6 胡笛;徐兆師;崔曉玉;陳明;李連城;馬有志;張小紅;;小麥鹽脅迫響應(yīng)基因TaSRP的克隆及功能鑒定[J];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年12期

7 陳先知;王燕;史建磊;朱隆靜;王克磊;徐堅(jiān);;黃瓜全基因組熱激轉(zhuǎn)錄因子(HSFs)的鑒定與表達(dá)分析[J];遺傳;2014年04期

8 陸虎華;孫權(quán)星;彭長(zhǎng)俊;陳小暉;薛林;胡加如;陳國(guó)清;石明亮;黃小蘭;郝德榮;冒宇翔;程玉靜;;不同播期對(duì)玉米粗縮病發(fā)生及鮮穗產(chǎn)量的影響[J];江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué);2013年09期

9 任志超;吳偉堅(jiān);李梅輝;符悅冠;;瓜實(shí)蠅雄蟲(chóng)引誘劑配方的篩選[J];熱帶作物學(xué)報(bào);2013年04期

10 Eunsook Chung;Kyoung-Mi Kim;Jai-Heon Lee;;Genome-Wide Analysis and Molecular Characterization of Heat Shock Transcription Factor Family in Glycine max[J];遺傳學(xué)報(bào);2013年03期

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3 張雙翔;程振濤;唐宇;冉隆仲;李濤;周碧君;文明;王開(kāi)功;王慧;;綿羊肺炎支原體熱休克蛋白Hsp70的生物信息學(xué)分析[J];中國(guó)畜牧獸醫(yī);2014年07期

4 傅誠(chéng)杰,繆煒,沈韞芬,萬(wàn)明亮;兩種緣毛類(lèi)纖毛蟲(chóng)胞質(zhì)Hsp70基因序列的克隆及其系統(tǒng)發(fā)育分析[J];動(dòng)物學(xué)研究;2004年04期

5 葛菲菲;劉佩紅;王建;沈莉萍;徐鋒;孫泉云;;乙腦病毒E蛋白中和表位與結(jié)核桿菌hsp70在大腸桿菌中的融合表達(dá)[J];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2008年02期

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7 張建華;李媛;王景芹;王亮;喬祖建;辛九慶;;山羊支原體肺炎亞種Hsp70基因克隆與序列分析[J];畜牧獸醫(yī)科技信息;2007年09期

8 崔旭紅;謝明;萬(wàn)方浩;;高溫脅迫下B型煙粉虱熱激蛋白基因hsp70表達(dá)量的變化[J];昆蟲(chóng)學(xué)報(bào);2007年11期

9 馬春驥;李敏;趙東;王玉炯;;綿羊肺炎支原體Y98株未知基因Hsp70(DnaK)的克隆[J];中國(guó)獸醫(yī)學(xué)報(bào);2011年12期

10 陸蓓玲;王蘭芳;;急性熱應(yīng)激后小鼠的抗氧化能力和Hsp70基因的表達(dá)[J];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2011年06期

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2 鄭金平;李瑞芳;張萍;孫建婭;郭亮;;Hsp70基因多態(tài)性及與環(huán)境和血脂因素交互作用對(duì)焦?fàn)t工人高血壓的影響[A];中國(guó)毒理學(xué)會(huì)第三屆中青年學(xué)者科技論壇暨2011年全國(guó)前列腺藥理毒理學(xué)研討會(huì)論文集[C];2011年

3 全睿;譚俊;商巾杰;陳保善;;板栗疫病菌線粒體蛋白Hsp70的功能研究[A];中國(guó)植物病理學(xué)會(huì)2010年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2010年

4 李志蓮;毛海萍;李志堅(jiān);張白玉;安欣;余學(xué)清;;Hsp70對(duì)大鼠UUO模型腎小管間質(zhì)纖維化的保護(hù)作用[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)腎臟病學(xué)分會(huì)2006年學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2006年

5 欒琪;高天文;李春英;王剛;沈柱;黨育平;李強(qiáng);;TAG1表位的預(yù)測(cè)及其Hsp70融合蛋白的表達(dá)、純化[A];2006中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合皮膚性病學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2006年

6 崔旭紅;謝明;萬(wàn)方浩;;高溫脅迫對(duì)B型煙粉虱熱激蛋白基因hsp70表達(dá)的影響[A];生物入侵與生態(tài)安全——“第一屆全國(guó)生物入侵學(xué)術(shù)研討會(huì)”論文摘要集[C];2007年

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1 戰(zhàn)銳;血漿Hsp70在動(dòng)脈粥樣硬化形成中的變化規(guī)律及其產(chǎn)生機(jī)制[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2008年

2 董小琴;TLR4抗體對(duì)Hsp70在自身免疫性?xún)?nèi)耳病中表達(dá)的干預(yù)性研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2008年

3 葛菲菲;結(jié)核桿菌hsp70在乙腦基因工程疫苗研制中的免疫增強(qiáng)作用[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

4 孫運(yùn)良;靶向重組腺病毒介導(dǎo)Hsp70基因表達(dá)治療胰腺癌的實(shí)驗(yàn)研究[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2011年

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2 王勇斐;水稻熱激蛋白（Hsp）的鑒定及其Hsp70家族的功能分析[D];福建農(nóng)林大學(xué);2012年

3 姜同泉;小鼠Hsp70基因序列分析及其在囊胚內(nèi)表達(dá)的研究[D];青島農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

4 汪寬福;小菜蛾hsp70基因的克隆及其在抗、敏品系中熱激表達(dá)差異研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2010年

5 許國(guó)耀;苯并[a]芘對(duì)體外培養(yǎng)大鼠神經(jīng)細(xì)胞Hsp70表達(dá)及損傷的研究[D];山西醫(yī)科大學(xué);2010年

6 諶金花;急性腦出血患者血清HIF-1α與VEGF、Hsp70之間的相關(guān)性研究[D];瀘州醫(yī)學(xué)院;2014年

7 周小飛;草魚(yú)熱休克蛋白Hsc70和Hsp70在免疫反應(yīng)中不同基因表達(dá)、蛋白質(zhì)合成和分泌的特征探討[D];電子科技大學(xué);2011年

8 陳康成;含MMT汽油對(duì)加油站工人外周血氧化應(yīng)激、Hsp70蛋白及認(rèn)知功能影響的研究[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2014年

9 欒琪;TAG-1抗原HLA-A2限制性表位的預(yù)測(cè)及其Hsp70融合蛋白的表達(dá)純化[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2005年

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本文編號(hào)：2301479