目的:1.運用加權基因共表達網絡分析(Weighted gene co-Expression network analysis,WGCNA)構建尤因肉瘤(Ewing’s sarcoma,ES)差異表達基因(differentially expressed genes,DEGs)的無尺度網絡,尋找ES患者臨床預后的關鍵基因,并挖掘可能參與的生物學功能。2.基于COX比例風險回歸分析,構建ES患者預后風險模型。3.ES相關的多張表達譜芯片聯合生物信息學分析,挖掘ES的核心基因及其相關的生物學功能。方法:1.從NCBI GEO數據庫下載尤因肉瘤相關的基因表達譜數據及其臨床相關信息。ES表達譜芯片數據獲取及篩選條件為:(a)數據來自人類的尤因肉瘤患者mRNA表達譜芯片的原始數據,而非動物模型,(b)含有ES組織和正常對照組織或無正常對照組織但有詳細臨床數據的ES患者的表達譜芯片的原始數據。2.利用RMA(Robust Multiarray Averaging)方法進行原始數據預處理,oligo包用于GSE68776與GSE6315,affy包用于GSE17679與GSE45544。3.GSE1...

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【學位級別】：碩士

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圖1-1AGSE17679DEGs熱圖（表達上調的25個基因和表達下調25個基因），紅色代表高表達，綠色代表低表達

圖1-1AGSE17679DEGs熱圖（表達上調的25個基因和表達下調25個基因），紅色代高表達，綠色代表低表達。圖1-1BES樣本層次聚類圖。圖中顏色對應樣本的不同生存間，生存狀態，年齡和性別。在生存時間一欄中白色代表生存時間短，紅色代表生存時長。在年齡一欄....

圖1-1BES樣本層次聚類圖

圖1-1AGSE17679DEGs熱圖（表達上調的25個基因和表達下調25個基因），紅色代高表達，綠色代表低表達。圖1-1BES樣本層次聚類圖。圖中顏色對應樣本的不同生存間，生存狀態，年齡和性別。在生存時間一欄中白色代表生存時間短，紅色代表生存時長。在年齡一欄....

圖1-2GSE17679中ES樣本中基因平均表達水平圖

7圖1-2GSE17679中ES樣本中基因平均表達水平圖

圖1-4模塊特征向量基因聚類圖

1-4模塊特征向量基因聚類圖。依據左側圖中設定的閾值（紅色線條）將塊合并形成右側模塊合并圖。

本文編號：4004452