目的利用甘肅省腫瘤醫(yī)院乳腺科甘肅省乳腺病診治中心和甘肅省醫(yī)學(xué)科學(xué)院腫瘤組織和淋巴細(xì)胞庫(kù)資源,用Taq Man Open Array基因分型系統(tǒng)聯(lián)合檢測(cè)與乳腺癌新輔助化療密切相關(guān)的基因及其SNPs。通過以下方面進(jìn)行深入研究:1.探討甘肅漢族婦女乳腺癌患者新輔助化療密切相關(guān)的基因的基因型分布。2.通過基因及其SNPs的研究,篩選新輔助化療方案療效和毒性相關(guān)的基因型分布。3.篩選與乳腺癌新輔助化療方案療效及預(yù)后相關(guān)的遺傳標(biāo)志物。方法依據(jù)不同的新輔助化療方案遴選符合入組條件的乳腺癌病例,化療前采集患者外周靜脈血2 m L,利用北京百泰克公司DNA提取試劑盒提取基因組DNA;提取的DNA,采用ND 2000超微量分光光度計(jì)檢測(cè)其濃度,要求所有DNA樣本濃度為20~80ng/μL,OD值在1.7~2.0之間;分裝于1.5 m L Eppendorf(EP)管中,-80℃冰箱保存?zhèn)溆?用美國(guó)應(yīng)用生物系統(tǒng)(Applied Biosystems,AB)的Taq Man技術(shù),采用Taq Man Open Array基因分型系統(tǒng)實(shí)施SNPs分析;所有患者按照RECIST標(biāo)準(zhǔn)評(píng)價(jià)療效;隨機(jī)選取5%的DNA樣本送金維智公司進(jìn)行PCR測(cè)序分析,以驗(yàn)證Taqman Openarray基因分型結(jié)果的可靠性;采用χ2檢驗(yàn)比較各基因型化療效果差異及療效關(guān)系,分析基因型分布頻率。結(jié)果1.MDR1 rs1045642各基因型頻率分別為AA(18.1%),AG(41.8%),GG(40.1%);MDR1 rs1128503各基因型頻率分別為AA(38.1%),AG(46.9%),GG(15.0%);CD44 rs187115各基因型頻率分別為CC(8.6%),CT(29.8%),TT(61.6%)。2.186例乳腺癌新輔助化療患者中,化療受益(CR+PR)為82例,總有效率為44.1%;TNM分期中,II期患者比例為44.6%,III期患者比例為53.2%,IV患者比例為2.2%。卡方檢驗(yàn)顯示,患者年齡、TNM分期與化療療效均無明顯相關(guān)性(p0.05)。3.在MDR1基因型rs1045642位點(diǎn)中,野生型(AA)、雜合型(AG)、突變型(GG)的受益率分別占總受益率的10.7%、17.5%、16.4%;AG型與AA型比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.098),GG型與AA型比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.081)。在MDR1基因型rs1128503位點(diǎn)中,野生型(AA)、雜合型(AG)、突變型(GG)的受益率分別占總受益率的21.1%,17.1%,5.4%;AG型與AA型比較,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.032),提示AA型的化療效果優(yōu)于AG型,GG型與AA型比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.131)。在CD44基因型rs187115位點(diǎn)中,野生型(CC)、雜合型(CT)、突變型(TT)的受益率分別占總受益率的4.0%,11.9%,28.5%;CT型與CC型比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.692),TT型與CC型比較,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(p=0.996)。4.MDR1 rs1045642 GG基因型與中性粒細(xì)胞減少癥相關(guān),III-IV度的發(fā)生率為2.8%(2/71),明顯低于AA(9.4%)和AG型(20.3%),χ2=7.188,p=0.027。未發(fā)現(xiàn)MDR1 rs1045642多態(tài)性與血紅蛋白減少、白細(xì)胞減少及血小板減少之間的關(guān)系。MDR1 rs1128503 GG基因型與中性粒細(xì)胞減少癥相關(guān),III-IV度的發(fā)生率為4.5%(1/22),明顯低于AA(10.8%)和AG型(27.5%),χ2=9.077,p=0.011。未發(fā)現(xiàn)MDR1 rs1128503多態(tài)性與血紅蛋白減少、白細(xì)胞減少及血小板減少之間的關(guān)系。CD44 rs187115 TT基因型與白細(xì)胞減少癥相關(guān),III-IV度的發(fā)生率為2.2%(2/93),明顯低于CC(23.1%)和CT型(6.7%),χ2=10.194,p=0.006。未發(fā)現(xiàn)CD44 rs187115多態(tài)性與血紅蛋白減少、中性粒細(xì)胞減少及血小板減少之間的關(guān)系。結(jié)論基因芯片檢測(cè)方法簡(jiǎn)單快速且高通量,適用于大規(guī)模樣本SNP調(diào)查;MDR1rs1045642位點(diǎn)、CD44 rs187115與化療敏感性無關(guān)、MDR1 rs1128503位點(diǎn)AA型的化療效果優(yōu)于AG型,可能作為乳腺癌新輔助化療敏感性的預(yù)測(cè)因子。



本文編號(hào)：1706539