體色是動物最為明顯的表型性狀,具有多種生物學功能,同時也是自然選擇和人工選擇的目標之一。脊椎動物擁有最多的色素類型及圖案,其中又以硬骨魚類的色素模式最為豐富。由于脊椎動物的色素細胞均起源于神經(jīng)嵴,而神經(jīng)嵴又涉及到許多種類細胞的發(fā)育,因此研究魚類體色的形成機制以及進化過程,可以為脊椎動物的進化提供深入見解。魚類體色的形成涉及到色素的合成和轉(zhuǎn)移、色素細胞的分化和遷移等過程,這些生物學活動中涉及到許多調(diào)控通路和基因的作用,同時也受到環(huán)境的影響。硬骨魚類中,鯉科魚類是體色類型最為豐富的種群之一。經(jīng)過多年選育,本實驗室已經(jīng)建立了4種體色甌江彩鯉的純系,包括“大花”(紅色底色黑色斑塊,RB)、“粉花”(白色底色黑色斑塊,WB)、“全紅”(紅色,WR)和“粉玉”(白色,WW),并且4種體色可以穩(wěn)定遺傳給下一代,這為甌江彩鯉的體色遺傳研究奠定了基礎。為初步探明各體色鯉的進化關系,篩選與鯉體色相關的候選基因,以及體色相關基因的調(diào)控作用,本論文以上述4種體色甌江彩鯉、興國紅鯉、荷包紅鯉及野鯉為實驗材料,利用基因組重測序技術挖掘鯉的體色相關基因,并通過基因編輯技術,驗證這些基因的功能,相關研究成果如下:1....

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【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖1-16種色素細胞注：A為黑色素細胞，B為黃色素細胞，C為藍色素細胞，D為虹彩色素細胞，E為紅色素細胞，F(xiàn)為白色素細胞

上海海洋大學博士學位論文2性條紋形成的關鍵，許多細胞表面分子與信號系統(tǒng)是這些交互作用的介質(zhì)[25-29]。這些研究都為魚類體色研究提供了重要的生物學信息。圖1-16種色素細胞注：A為黑色素細胞，B為黃色素細胞，C為藍色素細胞，D為虹彩色素細胞，E為紅色素細胞，F(xiàn)為白色素細胞Fig....

圖1-2黑色素合成通路Figure1-2Melaninsynthesispathway

上海海洋大學博士學位論文3在各類色素的合成機制中，當屬黑色素合成通路的研究最為廣泛和深入。黑色素通路的末端最終合成真黑素和褐黑素，兩種色素之間的比例受到Agouti[35]、MC1R[36]等多種基因的調(diào)控。真黑素所占比例越高，呈現(xiàn)的顏色越偏向黑色，褐黑素所占比例越高，顏色越偏向....

圖2-1文庫構(gòu)建與測序流程

上海海洋大學博士學位論文13Samtools軟件將比對結(jié)果按照染色體位置進行進一步的排序，利用Picard軟件對由于PCR過程中產(chǎn)生的重復reads進行標記，避免影響后續(xù)的變異檢測。圖2-1文庫構(gòu)建與測序流程Figure2-1Thebasicprcessoflibrarycons....

圖2-27種鯉的主成分分析

上海海洋大學博士學位論文17Disruptiveinframeinsertion8370.0000Stopretainedvariant3750.0000Downstreamgenevariant3,708,6340.1281Synonymousvariant398,9130.0....

本文編號：3998268